出口代理公司的收费方式较为多样，主要包括以下几种：

　　按货值百分比计费：这是较为常见的一种收费方式。通常代理公司会根据出口货物的报关金额来收取一定比例的代理费，比例一般在 0.5%-3% 左右。例如，如果货物总价值为 10 万美元，按照 1.5% 的费率计算，代理费用就是 1500 美元.不过，具体的比例会因货物种类、贸易模式、市场行情以及代理公司的服务内容和市场定位等因素而有所不同。

　　按工时计费：对于一些复杂程度较高、操作难度较大或者需要花费大量时间和精力处理的业务，代理公司可能会选择按实际工作时间来收费。收费标准可能是每小时几十元到几百元人民币不等，具体取决于业务的复杂程度和代理公司的定价策略。

　　按业务项目计费：

　　报关费用：根据货物的种类、数量、价值以及报关的复杂程度等因素来收取。一般来说，普通货物的报关费在 150-500 元人民币 / 票左右，如果货物需要特殊的监管条件或者涉及复杂的申报手续，报关费用可能会更高。

　　报检费用：如果货物需要进行检验检疫，代理公司会收取相应的报检费。报检费通常在 100-300 元人民币 / 票左右，具体费用取决于需要进行的检验类型和次数。

　　文件制作费用：包括商业发票、装箱单、提单等文件的制作和修改费用，一般在 50-200 元人民币 / 票左右，具体取决于文件数量和复杂程度。

　　运输费用：如果代理公司提供运输服务，会根据运输方式(海运、空运、陆运等)、运输距离、货物重量或体积等因素来计算运输费用。

　　仓储费用：如果货物需要在仓库中存储一段时间，代理公司会收取仓储费用，费用标准通常根据货物的存储时间和占地面积来计算。

　　增值服务费用：除了上述基本服务外，有些代理公司还会提供额外的增值服务，如买家资信调查、保险代理、物流方案设计等。这些增值服务通常会额外收费，收费标准也因服务内容和复杂程度而异。

　　固定费用：部分代理公司可能会针对某些特定的服务项目或业务类型收取固定的费用，例如，对于长期合作的客户或者批量出口的业务，代理公司可能会提供一个固定的服务套餐，收取固定的费用。

　　总之，出口代理公司的收费标准会因多种因素而有所差异，企业在选择出口代理公司时，应事先明确费用计算方式和具体收费标准，并在合同中进行详细约定。