超重的集装箱在港区进行装卸作业会面临许多挑战。首先，港区的装卸设备(如吊机、卡车、叉车等)都有其设计的最大承载能力，如果集装箱超重，可能会超出这些设备的安全操作范围，导致设备损坏或者作业安全风险增加。
如果集装箱超重，通常有以下几种处理方式：
支付超重费用：与船公司或港区协商，支付额外的超重费用和其他相关费用，以允许集装箱进行装卸作业。
重新包装货物：掏箱重新包装货物，以分散重量，使其满足港区和船公司的限重要求。
分箱：将过重的货物分成两个或更多的集装箱装载，以确保每个集装箱都在允许的重量范围内。
调整装载计划：如果超重情况严重，可能需要调整整个装载计划，甚至在中途港口卸下部分货物，重新安排运输。
特殊情况下的处理：在某些情况下，如果货物非常重要并且没有其他选择，则可能需要采取特殊的措施，比如租用特别的重型设备来进行装卸作业。
为了避免因集装箱超重而产生的额外费用和延误，托运人在装载前应当确保了解并遵守船公司和目的港的限重规定，并准确测量和申报集装箱的实际重量。根据国际海事组织(IMO)的规定，自2016年7月1日起，所有托运人都必须提供经验证的集装箱毛重(VGM)，否则集装箱不能装船。因此，正确申报集装箱重量不仅是合规的要求，也是确保运输顺利的重要步骤。
